Sihtasutuse Jõgevamaa Arendus- ja Ettevõtluskeskuse nõukogu moodustavad:
- Karro Külanurm – Põltsamaa vallavanem, JAEK nõukogu esimees
- Kristi Klaos – Põltsamaa valla abivallavanem
- Aivar Kokk – Jõgeva vallavolikogu liige
- Taavi Aas – Jõgeva valla vallavanem
- Indrek Kullam – Mustvee valla vallavanem
- Ülle Rosin – Mustvee vallavolikogu esimees
Sihtasutuse Jõgevamaa Arendus- ja Ettevõtluskeskuse juhatus on üheliikmeline.
Juhatuse liige on Aive Tamm.